荔枝蜂蜜半凝固情况与蜂蜜的结晶过程有关系，因为葡萄糖具有容易结晶的性质，而蜂蜜又是葡萄糖的过饱和溶液，所以蜂蜜结晶实质上是葡萄糖的结晶，在条件适宜的时候，蜂蜜中的葡萄糖小结晶核便逐渐增多、长大，成为结晶体母，并彼此连接起来，十分缓慢地向下沉降。
因此，容易下部的蜂蜜会率先结晶，然后逐渐向上发展，最后整个容器里的蜂蜜才会结晶成一体，而且蜂蜜的结晶是一个缓慢的过程，所以当底部的蜂蜜结晶之后，受到一些因素影响，结晶还没有向上发展的时候，蜂蜜就会出现一半结晶一半不结晶的分层现象就是所说的半凝固状态，这并不是蜂蜜本身的质量问题，其实是一种结晶过程中的正常现象。